顯微鏡圖像采集時，應調整檢測器和照明孔

       在實踐中，檢測器和照明孔應進行調整，以收集來自光源的最小區域的試樣，也包含所需的特征識別和上下文的信息。成像面積的較大增加了標本的照明，延長了傳感器的讀出時間。對于數碼相機，讀出的區域，可使用附帶的軟件包來控制和收購。相匹配的分辨率的圖像傳感器的分辨率也應考慮在內。

      激光掃描共聚焦顯微鏡也使用軟件選擇的區域進行圖像采集，巧妙地偽裝成一個變焦功能。使用此功能時，要注意的時放大倍數和空間采樣率，這經常是要重新計算的，顯微鏡軟件之間的相互作用的情況下，選擇一個小區域的圖像，并不會改變樣品像素的數目比例會則縮短了照明和讀出時間。在這種情況下，圖像的大小應與采樣率復位是受銘記分辨率的限制的。